Han pasado doscientos dos anos despues del mayor desastre de la humanidad conocido como 'La Gran Tragedia'. Los seres humanos se vieron forzados a vivir bajo tierra, ahora que la superficie es inhabitable para cualquier forma de vida, o al menos eso se creia. Luego de setenta anos empiezan a aparecer las quimeras, animales e insectos que mutaron por la radiacion existente en la superficie. Haise Satochi y Quin Evans, dos habitantes de la comarca de Inari se veran envueltos en la guerra de la humanidad contra las quimeras, lo cual indirectamente les hara descubrir parte de la historia perdida y los secretos que el gobierno de la nacion subterranea de Nakara les ha ocultado a la poblacion por tanto tiempo.